狗狗生下来畸形可能由多种因素导致。以下是一些可能的原因：

遗传因素：狗狗可能携带某种基因突变或遗传缺陷，这些基因问题可能导致小狗出现畸形。这种基因问题可能来自父母犬的遗传，也可能是突变产生的。一些品种的狗狗可能更容易受到特定遗传疾病的影响，这些疾病可能表现为肢体短缺、眼疾等缺陷。

营养不良：如果狗狗在怀孕期间没有得到足够的营养，特别是缺乏钙、磷、维生素D等关键营养物质，可能导致小狗的骨骼发育畸形等问题。

疾病与感染：怀孕期间，如果狗狗感染了某些疾病，如犬细小病毒、弓形虫等，这些病原体可能对胎儿的发育产生负面影响，导致畸形或其他健康问题。

药物或毒素暴露：如果狗狗在怀孕期间暴露在某些药物或毒素中，例如氯霉素、汞等，这些有害物质可能导致小狗出现畸形或其他健康问题。