硫酸庆大霉素在当前家禽治疗临床上的主要应用，大多用于治疗细菌性和支原体性疾病。比如说硫酸庆大霉素与头孢喹肟注射液一起配伍，治疗细菌性和支原体性的败血症、下呼吸道（气囊炎和栓塞）感染；把硫酸庆大霉素与扶正解毒，氨基比林一起配伍，治疗鸡子的滑液囊支原体病；或者用硫酸庆大霉素单独注射，治疗大肠杆菌、沙门氏菌导致的败血症等疾病。

硫酸庆大霉素也可以与阿莫西林硫酸粘菌素可溶性粉、复方阿莫西林粉、阿莫西林可溶性粉、氨苄西林可溶性粉等口服青霉素类制剂复配成方，这种把硫酸庆大霉素与青霉素类抗菌药的联合使用，可获得“1+1＞2”的协同抗菌作用的效果。

需要强调的是：硫酸庆大霉素与其它所有的氨基糖苷类药物一样，对家禽都有不同程度的潜在肾毒性副作用存在，家禽有肾脏疾病，肾功能不全的尽量不用。